【摘 要】
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传统双序列比对算法使用动态规划进行序列比对的速度慢,且准确性不高。为解决该问题,提出一种基于布尔逻辑的双序列搜索比对算法。根据一条序列中定长的碱基片段搜索2条序列
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传统双序列比对算法使用动态规划进行序列比对的速度慢,且准确性不高。为解决该问题,提出一种基于布尔逻辑的双序列搜索比对算法。根据一条序列中定长的碱基片段搜索2条序列的相似区,对相似区进行比对,包括相似区中碱基的比对以及子序列与另一条序列的比对,并通过并行执行机制实现加速比对。仿真实验结果表明,该算法具有较高的准确性和较好的实时性。
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