测序数据罕见遗传变异关联性分析方法评价

来源 :中国卫生统计 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yingxiong324

【摘要】

：

目的评价常见罕见变异统计分析方法的统计学性质,包括一类错误和检验效能,从而为分析罕见遗传变异资料的统计方法选择提供理论依据。方法通过计算机模拟试验的方法,对SKAT(se

【作者】

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夏德润沃红梅顾珩汪凯张曼婷唐少文赵杨易洪刚

【机构】

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南京医科大学公共卫生学院生物统计学系,南京医科大学医政学院社会保障教研室,南京医科大学公共卫生学院流行病学系

【出处】

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中国卫生统计

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

：

罕见变异关联性序列核函数关联性检验泛函主成分分析 Rare variantAssociationSKATFPCA

【基金项目】

：

江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015A067),江苏高校优势学科建设工程资助项目(公共卫生与预防医学),南京医科大学校级品牌专业建设工程南医大教[2015]101号

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目的评价常见罕见变异统计分析方法的统计学性质,包括一类错误和检验效能,从而为分析罕见遗传变异资料的统计方法选择提供理论依据。方法通过计算机模拟试验的方法,对SKAT(sequence kernel association test)和FPCA(functional principal component analysis)等方法从一类错误和检验效能等方面进行统计学性质评价。结果SKAT方法在各种检验水准下,第一类错误率均控制在检验水准附近,且其检验效能均高于其它方法,其中SKATO(optimal uni

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