家猪基因组含有大量保守非编码区

来源 :北京大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：dingxyz

【摘要】

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用190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区,得到大量含有保守非编码区的家猪序列.11.05%的家猪读序含有"猪-人"保守的非编

【作者】

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钟兰李蔚李松岗

【机构】

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北京大学生命科学院,中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心

【出处】

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北京大学学报：自然科学版

【发表日期】

：

2003年6期

【关键词】

：

随机读序保守的非编码序列非编码RNA基因 random reads conserved non-coding sequence(CNS) non-codin

【基金项目】

：

中国-丹麦家合作项目

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用190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区,得到大量含有保守非编码区的家猪序列.11.05%的家猪读序含有"猪-人"保守的非编码区序列,3.13%的家猪读序含有"猪-鼠"保守的非编码区片段,1.86%的家猪读序包含"猪-人-鼠" 三者保守的非编码区区域.三者保守的非编码区序列跟人的相似性明显高于跟小鼠的相似性.另外,很多人、小鼠的非编码RNA基因跟上述含有保守非编码片段的家猪序列至少比对上一次.

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