【摘 要】
：
nanoKAZ是一种体量小且底物专一性低的新型荧光素酶,具有高潜在应用价值,然而nanoKAZ与底物的作用方式未见报道.这里使用分子对接技术构建了 nanoKAZ与底物coelenterazine结
【机 构】
：
郑州轻工业大学食品与生物工程学院,郑州450001
论文部分内容阅读
nanoKAZ是一种体量小且底物专一性低的新型荧光素酶,具有高潜在应用价值,然而nanoKAZ与底物的作用方式未见报道.这里使用分子对接技术构建了 nanoKAZ与底物coelenterazine结合后形成的复合体构象,使用软件GROMACS对该复合体进行常温水溶液态的全原子动力学模拟并综合模拟过程中的酶主链运动特性,酶与底物间结合自由能变化与形成氢键情况分析nanoKAZ与底物作用方式.结果显示coelenterazine进入nanoKAZ空腔后借由与β桶区域内7个氨基酸残基产生强结合能并与其中Q12形成氢键以稳定分子朝向,同时coelentazine还促使催化腔口区域片段V27-V38(V27与coelenterazine形成氢键)和片段P61-H87在空间上彼此靠近从而关闭催化腔,稳定疏水的底物分子以促进催化反应发生.以上结果阐明了底物与nanoKAZ活性腔的结合方式,提出了 nanoKAZ-底物反应中间体的构象,为nanoKAZ的理性改造提供了理论基础.
其他文献
采用点击化学反应在UiO-66-NH2膜表面原位生长硅油润滑层,制备了金属有机框架(MOF)基防冰膜(OGMCs),通过硅油生长时间调控了表面硅油量,并对不同硅油含量的OGMC的防冰性能进
随着纳米科学技术的出现与发展,各种纳米材料层出不穷,碳量子点以其独特且优异的性质吸引了众多研究者的关注.碳源材料对碳量子点的合成及性质有着重要影响,我国煤炭储量相对
在社会学、心理学、生态学、保险学、医学、流行病学等领域,人们经常收集到各种各样的计数资料以研究它们的规律和特征.往往会出现计数数据不包含零观测值或零观测值过多的情形.一系列零截断和零膨胀离散模型也由此提出用于分析这一类数据,如零截断/零膨胀泊松分布、零截断/零膨胀负二项分布等.在利用这一类模型进行拟合时,对未知参数进行统计推断是必要的.已有的文献仅局限于解决单一模型的参数推断问题.本文基于近几年提出的零截断分布和零膨胀分布的随机表示,在统一的模型框架下,建立了计算参数极大似然估计的一般方法并应用于常见的离
综合应用相平面分析法和初值扰动椭圆函数展开法研究(2+1)维AKNS方程。给出了方程行波闭轨和同异宿轨的存在性,获得了方程含时间任意函数初始解扰动的椭圆正弦函数精确解,分析了所获解结构在初值扰动下的三类特征,讨论了初值扰动波的局域激发几何结构。所获结果丰富了该方程的可积意义和动力学内涵。
以过硫酸钾为插层膨胀剂,高锰酸钾为氧化剂,采用膨胀-氧化一步法制备了具有高阳离子交换容量的氧化石墨(GO).采用扫描电子显微镜、X射线衍射、傅里叶变换红外光谱和X射线光电
抗生素大量使用致使其在水环境中普遍存在,对生态环境和人类健康造成一定威胁.卤氧化铋BiOX(X=Cl,Br,I)具有独特二维层状结构、适宜的禁带宽度等优点而被用作光催化剂来降解
无表面活性剂微乳液近年来受到人们极大关注,但人们对该类微乳液体系的了解还不够深入,在许多基础问题上仍存在较大争议,因此十分有必要利用不同的技术手段对该类体系开展研
建立了电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)快速测定高纯钛中痕量铁的方法.采用氢氟酸和硝酸溶解高纯钛样品,稀释、定容后直接进入ICP-MS检测;采用标准加入法消除基体效应,避免了离
当今,测绘地理信息行业面临智能化和时空大数据时代的全球性挑战.以数据密集型计算为特征、人工智能为主要技术手段的新范式,提供了测绘地理信息行业解决这一挑战的变革性理
构建了乙醇-正丙醇-磷酸二氢钠(NaH2PO4)多元混合双水相体系萃取/检测环境水样中的诺氟沙星,讨论了醇的用量、盐的种类及浓度、pH值、温度对诺氟沙星分配行为的影响,并采用响