【摘 要】
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环状RNA（Circular RNA, circRNA）是一种具有闭合环状结构的非编码RNA,其在脂肪代谢中具有重要功能。本研究旨在鉴定猪脂肪组织中circIDH2,并对其功能进行分析。通过正反向引物扩增、Sanger测序、RNase R酶消化实验及qRT-PCR鉴定猪脂肪组织中的circIDH2,并研究其表达规律;运用RegRNA、TargetScan、RNAhybrid及Cytoscape软件
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31872336）； 三晋学者人才项目（2016;2017）；
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环状RNA（Circular RNA, circRNA）是一种具有闭合环状结构的非编码RNA,其在脂肪代谢中具有重要功能。本研究旨在鉴定猪脂肪组织中circIDH2,并对其功能进行分析。通过正反向引物扩增、Sanger测序、RNase R酶消化实验及qRT-PCR鉴定猪脂肪组织中的circIDH2,并研究其表达规律;运用RegRNA、TargetScan、RNAhybrid及Cytoscape软件对circIDH2靶向结合的miRNA以及miRNA调控的靶基因进行预测,构建ceRNA网络图。结果发现,circIDH2在猪脂肪组织中确实存在,其在猪各个组织中均有表达,并且随着日龄的增加,其在脂肪组织中的表达量呈先上升后下降的趋势。另外,本研究构建了与猪脂肪代谢相关的ceRNA网络,其中,circIDH2可与ssc-miR-129a-5p的种子序列结合,ACSL4、EBF1和NFIB也可与sscmiR-129a-5p的种子序列结合,是ssc-miR-129a-5p的靶基因。进一步对ssc-miR-129a-5p及其靶基因的表达分析发现,随着日龄的增加,ssc-miR-129a-5p的表达量呈先下降后上升的趋势,与circIDH2的表达趋势相反。ACSL4与EBF1的表达随着日龄的增加呈先上升后下降的趋势,NFIB的表达随着日龄的增加呈上升趋势。由此推测,circIDH2可能通过海绵化ssc-miR-129a-5p进一步调控ACSL4、EBF1及NFIB的表达来参与猪脂肪代谢调控。本研究结果可为circIDH2在猪脂肪代谢中作用机制的研究提供一定的理论基础。
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