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尽管目前对于子宫腺肌病的诊疗有了很大的进步，但其发病机制尚未明确。在过去的50多年里，研究者们提出了许多理论，最被广泛接受的是子宫腺肌病是由内膜基底层向下浸润生长嵌入肌层导致的，但内膜是如何浸润生长的仍在研究中。而子宫内膜－肌层结合带的自我损伤与自我修复导致子宫内膜浸润、增殖，在子宫腺肌病发生、发展中也起着重要作用。