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目前高校科研经费呈现连年增长趋势,高校科研经费管理过程中也凸显出一些新的问题。良好的科研经费管理机制对提高经费使用效率,保障高校科研工作的健康发展进行具有重要作用。科研项目经费流转过程的各个相关者都需要面对现状,就如何加强科研经费的管理,提高科研经费使用效益做出重新思考。本文从项目经费提供者、高校财务部门、项目负责人和项目经费审计者角度分析了高校科研经费管理存在的预算管理粗放,管理制度不健全,经费使用与预算不符等现状,探索了更加合理有效的科研经费管理办法,提出了改进和完善科研经费管理的措施。