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采用PCR产物直接测序法分别测定了尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）埃及品系、美国品系和吉富品系以及奥利亚罗非鱼（O．aureus）、尼奥罗非鱼（尼罗罗非鱼舍×奥利亚罗非鱼旱）的线粒体12SrRNA基因部分序列，并结合从Genbank中下载的尼罗罗非鱼同源序列进行了序列比对分析。结果表明，3个尼罗罗非鱼品系与从Genbank中下载的尼罗罗非鱼的同源序列仅有1处碱基不同，奥利亚罗非鱼和以奥利亚罗非鱼为母本的尼奥罗非鱼之间也仅有1处碱基不同，但是3个尼罗罗非鱼品系以及从Genb