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20世纪80年代DNA重组的出现，为研制新1代疫苗提供了新方法。主要有亚单位疫苗、活载体疫苗、核酸疫苗、肽疫苗等，这些统称为基因工程疫苗或重组疫苗。基因工程疫苗能够克服传统疫苗的许多缺陷，采用更加安全有效的方法，代替昂贵的传统工艺。兽用基因工程疫苗的安全问题比较容易控制和处理，因此基因工程疫苗将在兽用疫苗生产上首先得到突破。