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选取258份国内外烤烟品种，在2个试验点调查13个农艺性状，利用16对引物组合获得的597个SRAP标记进行分子遗传多样性和群体结构分析，选取适宜的模型进行农艺性状与SRAP标记间关联分析。结果表明，参试品种表型和基因型变异丰富，国内品种的遗传多样性低于国外品种。总材料可分为7个亚群，分类结果与材料的地理来源和遗传背景显著相关，国外材料遗传结构相对复杂。通过比较发现MIM_Q＋K和MIM-PCA＋K为该群体最优的关联分析模型，共检测到18个SRAP标记与6个农艺性状显著关联（-logP〉2，P〈0．01）