【摘 要】
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为了解广西新型鸭呼肠孤病毒（novel duck reovirus,NDRV）流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段进行全基因组序列扩增,经克隆、测序、拼接后,获得1株NDRV全基因组序列（命名为GX01-2020株）。结果显示,GX01-2020株基因组全长23 353 bp,分为10个片段,大小从1 194 bp（S4）至3 958 bp（L1）不等。同源性分析显示,GX01-2020株
【机 构】
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广西壮族自治区动物疫病预防控制中心
【基金项目】
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广西自然科学基金资助项目（2020GXNSFBA297066）； 广西农业科技基金资助项目（Z201984,Z202032）；
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为了解广西新型鸭呼肠孤病毒（novel duck reovirus,NDRV）流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段进行全基因组序列扩增,经克隆、测序、拼接后,获得1株NDRV全基因组序列（命名为GX01-2020株）。结果显示,GX01-2020株基因组全长23 353 bp,分为10个片段,大小从1 194 bp（S4）至3 958 bp（L1）不等。同源性分析显示,GX01-2020株10个片段核苷酸同源性与NDRV代表毒株最高,为86.2%～99.4%,其中μB片段核苷酸同源性最低的毒株为番鸭呼肠孤病毒（Muscovy duck reovirus,MDRV）,其他片段则为鸡源禽呼肠孤病毒（chicken-origin reovirus,CRV）,说明不同片段来源祖先不完全相同。遗传进化分析显示,10个片段遗传进化树中,L2、L3片段中MDRV参考毒株及σA片段中NDRV参考毒株均形成两个进化分支,与其他片段不同,说明不同片段与参考毒株的遗传关系不尽相同。重组分析显示,GX01-2020株的L1片段存在重组信号,重组亲本毒株分别为北京MDRVJ18株和福建DRVNP03株。本研究丰富了NDRV基因库相关信息,同时为广西地区NDRV的分子流行病学研究和有效防制措施制订提供了一定的参考。
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