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构建高密度饱和的分子遗传图谱是全面系统进行QTL定位的基础。近年来，随着分子标记技术及统计分析方法的迅速发展，许多作物已构建了较为饱和的分子遗传图谱，利用这些图谱已定位了不少重要性状QTL。棉花的分子标记及QTL定位研究较晚，但进展很快。为此，综述了近年来棉花的分子遗传图谱构建，以及重要性状，包括产量、纤维品质、抗性、形态、生理、早熟性等QTL定位的研究进展，并对当前存在的问题进行了分析和探讨。