α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失

来源 :微生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hbshwydd

【摘要】

：

在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失（CSIs）。23S

【作者】

：

吕志堂王静周燕霞张维维

【机构】

：

河北大学生命科学学院河北省微生物多样性研究与应用实验室,药物化学与分子诊断教育部重点实验室（河北大学）

【出处】

：

微生物学杂志

【发表日期】

：

2016年2期

【关键词】

：

α-变形菌纲保守特征性插入缺失系统发育基因组学 α-Proteobacteria conserved signature indels（CSIs） ph

【基金项目】

：

河北省生物工程重点学科建设项目（1050-5030023）, 河北省生物学强势特色学科建设项目（1050-5030004）

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在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失（CSIs）。23S rRNA基因具有1个98-105 nt的特征性缺失和1个5-7 nt的特征性插入,DNA复制解旋酶（DnaB）具有1个17-29 aa的特征性插入,精氨酰-tRNA合成酶（ArgRS）具有1个15 aa的特征性插入,DNA促旋酶A亚基（GyrA）具有1个27-63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变

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