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云南省农业科学院经济作物研究所成立于2004年3月，是在原云南省农科院油料作物研究所（成立于1979年）和云南省农科院生物技术研究所部分课题的基础上组建而成的专业农业经济作物研究机构，主要从事马铃薯、油菜、亚麻、蓖麻、大麻、红花、花生、芝麻、木薯、甘薯、小桐子、迷迭香、紫苏等作物的资源收集整理、利用分子技术和常规技术选育良种、优化栽培技术措施的研究。