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使用MseI限制性内切酶对放线菌链霉菌属中的12株菌基因组DNA进行酶切，与接头连接后，引物使用一个选择性碱基对模板进行PCR扩增，PCR产物在琼脂糖凝胶上进行电泳检测。结果表明，对于MseI内切酶产生的模板，选择性碱基采用A、T、C和G都能够获得清晰丰富的条带。MseI内切酶产生的图谱上有72个位点，多态性位点71个，达98．6％。因此，使用MseI内切酶适合构建放线菌的单酶切AFLP指纹图谱。