基于混合二阶隐马尔可夫模型的基因结构预测

来源 :电脑知识与技术 | 被引量 : 0次 | 上传用户：gjpttkl

【摘要】

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在基因预测时,待研究的生物序列中的残基(氨基酸或核甘酸)具有高度的相关性,因此,观测噪声和马尔可夫链不相互独立的条件下的混合隐马尔可夫模型比普通隐马尔可夫模型更适用

【作者】

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张慧丽

【机构】

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中南民族大学计算与实验中心

【出处】

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电脑知识与技术

【发表日期】

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2007年14期

【关键词】

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混合二阶隐马尔可夫模型 Baum-Welch算法 VITERBI算法基因预测 mixture of HMM2 Baum2Welch algorithm Vit

【基金项目】

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中南民族大学校自然基金青年项目(YZQ03006)

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在基因预测时,待研究的生物序列中的残基(氨基酸或核甘酸)具有高度的相关性,因此,观测噪声和马尔可夫链不相互独立的条件下的混合隐马尔可夫模型比普通隐马尔可夫模型更适用于基因预测功能.介绍了一种基于混合二阶隐马尔可夫模型(HMM2)的基因识别系统,该系统的预测精度在在核苷酸和外显子水平上均与国外同类研究水平相当.

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