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人芽囊原虫(Blastocystis hominis)是寄生在人类肠道内可致病的寄生原虫。呈全世界分布,在东南亚、南美等发展中国家尤为多见。据报道早在1899年,Perroncito就已详细描述了人芽囊原虫的形态特点,1912年Brump将其正式命名为人芽囊原虫,但长期被误认为是一种对人体无害的肠道酵母菌。