Single-cell RNA sequencing 的正则化方法

来源 :广州大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:deansam
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正则化是scRNA-seq数据分析的核心并影响决定下游分析的质量.相比bulkRNA-seq,由于scRNA-seq的zero inflation,其正则化是一个尚未解决的问题.本研究给出了一个bias analysis framework对现有的scRNA-seq正则化方法进行评估比较.这个bias analysis framework对scRNA-seq正则化提供了理论基础.同时作者比较了广为使用的bulkRNA-seq正则化方法,以及专为scRNA-seq设计的正则化方法在scRNA-seq基准数据
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