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紫云英根瘤菌159含2个拷贝的nodD基因。核苷酸序列测定表明由nodD1和nodD2基因所推定编码的NodD1和NodD2蛋白其氨基酸顺序同源性为69%。功能分析显示,在紫云英根瘤菌中nodD1和nodD2基因均能自主表达。由nod1推定的NodD1能与紫云英种子浸出液(诱导物)共同激活nod基因的表达,而由nodD2R推定的Nod2则无此功能。