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随着国家对科研机构、科学工作者“放管服”管理持续推进,对科学事业单位的内部管控和财务预算管理也提出了更高要求,科学事业单位因机构特点有特殊的预算编制特点,在改革推进的过程中也必然面临一些问题。因此科学事业单位应当尽快适应国家新预算方法的推进实施,创建新型预算管理模式。本文立足科学事业单位预算编制的内涵和特点,分析当前预算编制中存在的矛盾点,提出针对性解决方法。