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生态环境系统是指将一切对大学生思想政治教育活动开展及其效果产生各种影响的内外部因素之关系及结构的总和，并将其进一步分为微观、中观和宏观生态环境。高校思想政治理论课建设与生态环境有着密不可分的联系。在微观生态环境下把握高校思想政治理论课建设的走势，在中观生态环境中做好高校思想政治理论课内容的衔接，在宏观生态环境下解决大学生思想政治理论课建设面临的新问题。