目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)对重症监护病房(ICU)内脓毒症患者治疗及预后的影响。方法收集2017年9月至2018年12月入住南通市第三人民医院ICU并送检mNGS脓毒症患者的一般临床资料、mNGS报告、送检mNGS前后的临床微生物学报告,评估mNGS报告与临床微生物学报告及临床判断的一致性、mNGS回报后是否调整治疗及调整效果。结果研究期间共20例患者送检mNGS,平均年龄(58.15±17.30)岁,入ICU时急性生理学与慢性健康状况评估系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分(23.00±9.48)分,送检前序贯器官衰竭(SOFA)评分5(4～11)分。ICU病死率及住院28 d病死率分别为45%和60%。20例患者共送检22例样本,其中血液标本12例,支气管肺泡灌洗液(BALF)标本4例,痰液标本3例,脑脊液(CSF)标本2例,腹水标本1例。20例患者检出病毒、G~-菌、G~+菌、真菌及结核分枝杆菌分别为11、9、3、6、1例。mNGS检出阳性率显著高于传统微生物学报告(19例vs.8例,P<0.01)。与临床判断对比,mNGS符合率亦显著高于传统微生物学报告(18例vs.7例,P<0.01)。14例患者根据mNGS结果调整治疗,9例患者调整后临床症状改善。结论 ICU内脓毒症患者应用mNGS可以提高病原检出阳性率,有效指导治疗,可能改善预后。