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《水生动物病原微生物学》是教育部2013年设立的新专业——＂水生动物医学＂的专业基础必修课之一,经两年的建设与实践,该课程取得了较好的教学效果。为给国内其他高等院校的相关课程建设提供参考,从《水生动物病原微生物学》课程建设的必要性、教学理念、课程内容及教学效果分析等方面阐述了该课程的建设思路和构想。