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采用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ凝胶电泳及电转移方法，将增溶的鼠肝线粒体胆碱脱氨酶进一步纯化，且去掉增溶线粒体胆碱脱氢酶中所包含的大部分磷脂、去垢剂、辅基ＦＡＤ等、，对进一步纯化的ＣＤＨ进行了Ｎ端氨基酸序列测定，得到ＣＤＨ Ｎ端１０个氨基酸残基序列为ＶＡＡＡＡＧＧＧＫＤ，这一部分序列与小ＣＯ５蛋白、大鼠腺苷酰环化酶、人甾体结合蛋白（ｏｘｙｓｔｅｒｏｌ－ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ）有很高同源性，但与大肠杆菌Ｃ