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脑神经系统的非线性动力学特征是：它具有非线性、混沌性、突变性、自组织性及不可逆性等。脑神经系统是人类生命的中枢系统，这个系统是一个非线性动力学的复杂系统，由一个远离平衡态的耗散结构，综合构成了脑神经系统的整体性、复杂性。从方法论的角度对脑神经系统的整体性、复杂性进行了思考，并提供了一个方法论的理论框架，及具体的技术方法。