【摘 要】
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在现有RT-PSM算法的基础上,完成蛋白质数据库酶切成肽段数据库的转换过程,提出有效峰提取的优化策略,设计一个肤段鉴定算法--FPI-PSM.对于没有翻译后修饰的情形,采用Keller数
【机 构】
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中国科学技术大学计算机科学技术系,安徽省高性能计算重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金资助重点项目＂当代并行机的并行算法应用基础研究＂（60533020）
论文部分内容阅读
在现有RT-PSM算法的基础上,完成蛋白质数据库酶切成肽段数据库的转换过程,提出有效峰提取的优化策略,设计一个肤段鉴定算法--FPI-PSM.对于没有翻译后修饰的情形,采用Keller数据集进行测试.与RT-PSM算法相比,FPI-PSM算法的灵敏度提高了5%,每个质谱的平均鉴定时间从13.6 ms下降到5.6 ms.
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