【摘 要】
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目的 通过生物信息学分析,筛选舌鳞状细胞癌(鳞癌)组织和正常组织差异表达基因(DEGs),筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法 从公共基因表达数据库(GEO)下载舌鳞癌芯片
【机 构】
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山东大学齐鲁医院青岛院区口腔科,淄博市中心医院口腔科
【基金项目】
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山东省重点研发计划项目(2017GSF221008,2018-GSF118008);山东大学齐鲁医院(青岛)院内基金项目(QDKY2016-QN09)
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目的 通过生物信息学分析,筛选舌鳞状细胞癌(鳞癌)组织和正常组织差异表达基因(DEGs),筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法 从公共基因表达数据库(GEO)下载舌鳞癌芯片数据,利用R语言Limma程序包筛选DEGs,利用韦恩图筛选不同数据集的共同DEGs,对共同DEGs进行GO和KEGG富集分析、蛋白相互作用网络分析及网络关键基因生存分析。结果 筛选出不同数据集的共同DEGs297个,这些基因参与血管新生、细胞黏附、氧化还原等过程,并参与细胞外基质受体相互作用通路、黏着斑通路、小细胞肺癌通路、To
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