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嵌入式Linux系统最少需要三个基本元素：引导程序、Linux微内核(由内存管理、进程管理和事务处理构成)和初始化进程。根据需要，Linux微内核可决定是否支持文件系统、TCP／IP网络功能等，如果要让它有更多的功能且保持小型化，还可加上MINGUI(微图形用户界面)和设计精简的应用程序。基于软盘的Linux系统与一般的基于硬盘的Linux系统结构类似，主要由Linux内核和根文件系统组成，由BIOS引导。