【摘 要】
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目的:基于网络药理学探讨莪术油治疗胃癌的潜在活性成分及相关分子机制.方法:查阅相关文献,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合数据库(TCMID)及PubChem数据库检索莪术油的化学成分,并上传至Swiss Target Prediction平台获得潜在作用靶点;从GEO数据库获取GSE54129芯片数据,使用R语言获取胃癌组织与正常组织的差异表达基因;利用Cytoscape构建莪术油活性成分-靶点网络,采用Bisogenet构建莪术油治疗胃癌的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,
【机 构】
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北京大学第一医院中医中西医结合科 北京大学中西医结合研究所 北京,100034
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目的:基于网络药理学探讨莪术油治疗胃癌的潜在活性成分及相关分子机制.方法:查阅相关文献,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合数据库(TCMID)及PubChem数据库检索莪术油的化学成分,并上传至Swiss Target Prediction平台获得潜在作用靶点;从GEO数据库获取GSE54129芯片数据,使用R语言获取胃癌组织与正常组织的差异表达基因;利用Cytoscape构建莪术油活性成分-靶点网络,采用Bisogenet构建莪术油治疗胃癌的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,根据拓扑参数筛选关键网络;运用Metas-cape数据库对关键网络中的靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析;最后,利用Cytohubba插件及拓扑分析筛选莪术油治疗胃癌的关键基因,并使用ONCOMINE数据库分析关键基因在胃癌中的表达情况.结果:从文献和数据库中获得莪术油30个化学成分,该成分对应的靶点共有487个,莪术醇、莪术二酮、新莪术二酮、莪术烯醇、异莪术烯醇、吉马酮为莪术油的主要作用成分;分析GSE54129芯片得到507个胃癌差异表达基因,与莪术油共有28个交集靶点;构建PPI网络并进一步筛选获得115个特征性靶点组成的关键网络;GO分析和KEGG信号通路分析表明,莪术油治疗胃癌主要参与了凋亡信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Wnt信号通路、TGF-β 信号通路等信号通路;并从关键网络中得到MCM2、ENO1、TP53、VCP等7个关键靶点,该关键基因在胃癌样本和正常样本中均存在显著表达差异.结论:该研究通过网络药理学结合生物信息学的方法初步预测了莪术油治疗胃癌的潜在活性成分、关键靶点和相关的信号通路,体现了莪术油治疗胃癌多成分、多靶点、多通路的整体协调作用,为后续进一步的基础实验与临床研究提供了理论依据.
其他文献
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种不明病因的慢性非特异性肠道炎性疾病,病变黏膜炎症具有连续性、弥漫性的特点.近几十年来,本病在发展中国家的发病率逐年上升,而且具有一定的癌变倾向[1].肠镜及病理组织学检查一直是UC确诊的金标准,肠镜检查也是本病治疗的重要手段之一.
目的:通过观察恒古骨伤愈合剂对膝骨关节炎患者的症状改善情况,评价恒古骨伤愈合剂的临床疗效.方法:将60例门诊患者随机分为恒古组及对照组,每组各30例.对照组口服盐酸氨基葡萄片(0.48 g/次,3次/d),辅以股四头肌锻炼;恒古组口服恒古骨伤愈合剂(每次25 mL,隔天1次),辅以股四头肌锻炼,两组都治疗3个月,分析治疗前后患者中医证候疗效、WOMAC指数、VAS评分、满意度,评价治疗效果.结果:两组患者治疗前一般资料比较差异无统计学意义(P＞0.05);两组治疗后中医证候疗效、WOMAC指数、VAS评分
目的:探索中药专利复方治疗食管癌的用药规律.方法:通过中国专利公布公告(http://epub.si-po.gov.cn/)搜集所有治疗食管癌的中药处方并进行筛选处理,利用数据挖掘技术对用药及配伍规律进行挖掘分析.结果:共筛选出治疗食管癌的中药专利复方210首,常用药物40味,包括半夏、甘草、白花蛇舌草、半枝莲、黄芪、人参、当归等;常见药对14个,包括半枝莲-白花蛇舌草、丹参-半夏、全蝎-蜈蚣、旋覆花-半夏、旋覆花-代赭石等;聚类分析得到6类药物;核心网络包括37味中药.结论:治疗食管癌的中药专利复方药物
胃癌是我国常见的恶性肿瘤之一,其发病率位于我国恶性肿瘤发病率的第2位[1].胃恶性肿瘤处于早期时常无特殊的症状及体征,不易被发现,近年来随着胃镜检查的普及,早期胃癌诊出比例逐年提高[2].手术切除作为早期胃癌的主要治疗手段,极大提高了胃癌患者的存活率,但由于手术对胃结构的破坏,致使脾胃功能失常,加之其他致病因素的影响,患者术后常出现并发症,严重影响生活质量及后期治疗的选择.中医药在胃癌术后并发症的治疗中优势明显,以下就中医药在胃癌术后并发症中的应用做一探讨.
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种主要侵及直肠和结肠的黏膜层及黏膜下层,表现为充血、水肿、糜烂、溃疡的非特异性炎症性疾病,患者主要表现为腹痛、腹泻和黏液血便[1].本病属于中医泄泻、久痢、大瘕泄等范畴,因其症状时轻时重,反复发作,缠绵难愈,故也被列为世界难治性疾病之一.
目的:利用网络药理学探讨白花蛇舌草防治大肠腺瘤的作用靶点、生物过程及相关通路,结合中医学的认识,进一步探讨其干预癌前病变的可行性及潜在机制.方法:在Gene Cards和OMIM数据库获取大肠腺瘤疾病的靶点,中药系统药理学数据库(TCMSP)中检索白花蛇舌草的成分并获取靶点信息,用Cytoscape 3.8.0软件对白花蛇舌草-大肠腺瘤可视化构图,并构建蛋白质相互作用网络.对白花蛇舌草-大肠腺瘤作用靶点进行GO富集分析、蛋白质相互作用网络、KEGG通路富集分析.结果:白花蛇舌草防治大肠腺瘤的作用机制中,可
大黄蛰虫丸(Dahuang Zhechong pill,DZP)出自于张仲景所著的《金匮要略·血痹虚劳病脉症并治第六》[1]:“五劳虚极羸瘦,腹满不能饮食,食伤、忧伤、饮伤、房室伤、饥伤、劳伤、经络营卫气伤,内有干血,肌肤甲错,两目黯黑.缓中补虚,大黄蛰虫丸主之.”其具有活血破瘀、缓中补虚的作用,现代临床中常被广泛用于各类肝脏疾病的治疗,如肝炎、肝硬化、肝癌等瘀血内结患者,且其在心血管疾病、妇科、皮肤美容等方面均取得了较好的疗效[2].
目的:探讨槐耳浸膏对结直肠癌细胞活性氧(ROS)的调控作用及细胞侵袭能力的影响.方法:利用PKC激动剂佛波酯(TPA)处理人结直肠癌SW480细胞,倒置显微镜下观察TPA诱导细胞形态学的改变;MTT法检测不同浓度槐耳浸膏对细胞增殖的影响;Western blot检测基质金属蛋白酶-9(MMP-9)和核内p50、p65蛋白表达水平;明胶酶谱法检测MMP-9细胞外分泌情况;流式细胞仪测定细胞内ROS含量;Transwell侵袭实验检测细胞的侵袭能力.结果:TPA诱导下SW480细胞由上皮样转变为间叶样细胞形态
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目的:比较加味三黄泻心汤联合艾司奥美拉唑、阿莫西林、枸橼酸铋钾与含克拉霉素标准四联疗法治疗Hp的疗效.方法:选取消化内科门诊85例经13C-尿素呼气试验(13C-UBT)证实Hp感染并伴有相关临床症状的患者.随机分成2组,A组予加减三黄泻心汤联合艾司奥美拉唑、阿莫西林、枸橼酸铋钾方案;B组予含克拉霉素标准四联方案,予以Hp根除治疗.结果:A组Hp根除率为82.22％,B组Hp根除率为82.50％,2组差异无统计学意义(P＞0.05).A组临床症状改善率为81.85％,优于B组(63.44％),差异有统计学