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目的
比较Autof MS、Asta MicroIDsys和Bruker Biotyper三种商业化基质辅助激光解析电离飞行时间质谱系统对常见微生物的鉴定效能。
方法方法学评价研究。收集2011至2018年本实验室食品中分离菌株及2016至2018年中国人民解放军总医院临床常规分离菌株共169株,经生化鉴定、16S rDNA或ITS测序,分属39个属,95个种。采用扩展直接涂抹法平行使用三种质谱系统进行鉴定,其中革兰阴性细菌(G-)93株、革兰阳性细菌(G+)65株、酵母菌11株。采用SPSS 18.0软件对数据进行统计分析。
结果169株菌株质谱鉴定在种水平置信度得分和可信任得分水平中,Autof MS质谱系统、Asta MicroIDsys质谱系统和Bruker Biotyper质谱系统准确鉴定率分别为91.1%(154/169)、86.4%(146/169)和81.7%(138/169),Autof MS和Bruker Biotyper之间差异具有统计学意义;在属水平鉴定中,Autof MS质谱系统准确鉴定率为98.8%(167/169),Asta MicroIDsys和Bruker Biotyper质谱系统准确鉴定率均为97.0%(164/169),三种质谱系统之间差异无统计学意义。
结论三种质谱系统对常见微生物均有很好的鉴定效能。依据各质谱系统的鉴定分值评判原则,Autof MS质谱系统在种可信水平上的准确鉴定率较高。