中国大林姬鼠携带Amur类汉坦病毒及其分子生物学特征分析

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目的 确定中国大林姬鼠是否存在Amur类汉坦病毒及其分子生物学特征.方法 应用RT-PCR法扩增大林姬鼠肺组织中汉坦病毒M基因片段和S基因全长,目的 片段经测定其核苷酸序列后,用DNASTAR软件进行同源性比对和系统发育分析.结果 从东北大林姬鼠肺标本JilinAP06中分别扩增出长度383 bp(M基因)和1696 bp(S基因)大小的目的cDNA片段,其S基因全长由1696个核苷酸组成,完整的开放阅读框从37位核苷酸至1323位核苷酸,共1287个核苷酸,编码429个氨基酸的蛋白.JilinAP06 S基因与B78、Liu株同源性最高,与H5株同源性次之,与AP63、AP61和AP1371同源性为91.0%~91.7%,与76-118同源性为81.0%.S全序列基因推导的氨基酸序列与其他汉坦病毒已知序列比较显示:JilinAP06与AP1371同源性最高(98.4%),与AP61同源性为98.1%,与AP63和Liu、B78和H5株同源性为97.2%~97.9%,与76-118同源性为95.1%.系统发育分析结果显示:JilinAP06与Amur类汉坦病毒构成一个相对独立的分支.M基因片段同源性比较和系统发育分析结果与基于S基因全长得到的结果一致.结论 中国大林姬鼠存在Amur类病毒,大林姬鼠很可能为Amur类病毒的自然宿主和人群Amur类病毒感染的重要来源.
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