【摘 要】
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目的筛选宫颈鳞状细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),并对其结合的miRNA及下游mRNA进行生物信息学分析。方法GEO数据库查找宫颈鳞状细胞癌circRNA表达谱芯片,利用GEO2R软件
【机 构】
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广州医科大学附属第六医院清远市人民医院
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目的筛选宫颈鳞状细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),并对其结合的miRNA及下游mRNA进行生物信息学分析。方法GEO数据库查找宫颈鳞状细胞癌circRNA表达谱芯片,利用GEO2R软件分析芯片,获得差异表达的circRNA,选择表达上调、下调最显著的5个circRNA。利用CSCD网站预测circRNA结合的miRNA,进一步通过三个生物信息学网站(miRDB、TargetScan、RNAInter)联合预测miRNA下游的mRNA,并对其进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KE
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