仙台病毒核酸测序检测方法的建立

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目的建立仙台病毒(SeV)的核酸测序检测方法。方法根据SeV序列设计覆盖不同毒株的通用引物,然后优化成测序引物并摸索建库条件,进行核酸测序和结果分析。结果获得l对特异性强的通用引物,序列为:上游引物5’-GCTGCAAAACGCTGTGGG-3’,下游引物5’-TGGRACYTCAGAAAGAATRGG.3’;建库条件优化为:第一轮以cDNA为模板用通用引物扩增,第二轮以第一轮产物为模板用测序引物扩增。测序分析可以有效地将SeV与其他微生物区分开,并且精确到TianJin亚株。结论建立了SeV核酸测序检测
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