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土壤中甲烷的形成有2条途径:乙酸发酵和H2/CO2还原.比较而言,乙酸发酵产甲烷的能力强于H2/CO2还原.在特定环境中,何种产甲烷途径占优势取决于底物尤其是活性有机碳含量,而新形成的有机碳尤为重要.活性有机碳含量丰富的沼泽,甲烷主要由乙酸发酵形成,因此产甲烷能力较强.导致沼泽产甲烷能力异同的原因就是有效底物含量差异,从而使不同类型沼泽环境中产甲烷菌菌种不同,正是底物含量的高低和由此引起的产甲烷菌菌种的不同决定了不同类型沼泽产甲烷潜能的差异.