【摘 要】
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目的 筛选棘球蚴病(包虫病)潜在诊断标志物的游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)序列,并初步探讨其诊断价值. 方法 从西藏自治区采集确诊细粒棘球蚴病患者外周血,分离血浆,提取cfD
【机 构】
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中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,国家热带病研究中心,世界卫生组织热带病合作中心,科技部国家级热带病国际联合研究中心,卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室,上海200025;西藏自治区疾病预防
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目的 筛选棘球蚴病(包虫病)潜在诊断标志物的游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)序列,并初步探讨其诊断价值. 方法 从西藏自治区采集确诊细粒棘球蚴病患者外周血,分离血浆,提取cfDNA并重测序;对测序数据进行生物信息学分析,并与人参考基因组和细粒棘球绦虫基因组综合比对,筛选诊断标志物候选序列;分别以细粒棘球蚴病患者和健康人血浆cfDNA为模板,采用qPCR分析诊断标志物候选序列的特异性和敏感性. 结果 共采集6份细粒棘球蚴病患者血浆,提取的血浆cfDNA条带较为均一,主要集中于150～200 bp;经重测序和序列比对获得一组候选序列,qPCR分析后初步筛选出一条101碱基的序列,用其检测8例细粒棘球蚴病患者血浆cfDNA,其中5例阳性,敏感性为62.5％;检测健康人血浆的特异性为87.5％(7/8). 结论 细粒棘球蚴病患者血浆中存在虫源cfDNA,该序列具有作为诊断标志物的潜在价值.
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