【摘 要】
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通过对比不同尾椎数的蒙古绵羊群体在基因组上的遗传分化水平,对全基因组选择信号、蒙古羊尾长性状的相关基因及可能的突变位点进行检测,试图解析尾椎形成的分子机制。基于全
【机 构】
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内蒙古自治区农牧业科学院; 内蒙古ATCG生物信息研究所; 内蒙古犇牛科技有限公司; 扎兰屯市农牧业局畜牧工作站; 内蒙古农业大学动物科学学院;
【基金项目】
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“十二五”农村领域国家科技计划(2015BAD03B0505);国家肉羊产业技术体系建设项目(CARS-38);内蒙古农牧业科学院创新基金项目(2017CXJJM01-2,2018CXJJM02);内蒙古自治区科技创新引导项目(KCBJ2018054);2018年内蒙古科技计划重点项目
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通过对比不同尾椎数的蒙古绵羊群体在基因组上的遗传分化水平,对全基因组选择信号、蒙古羊尾长性状的相关基因及可能的突变位点进行检测,试图解析尾椎形成的分子机制。基于全基因组重测序数据,使用两组群间的遗传分化系数(Fst)和遗传多样性比率(pi ratio)检测尾椎选择信号,将Fst值和pi ratio较大的染色体区段作为受选择候选区域。结果表明,共找到76个选择区域,这些区域分别落在了尾脂肪沉积和骨骼发育的QTL上,进一步对这些候选区域所包含的63个基因进行基因功能及通路的注释分析,富集到骨骼再生相关的Wnt和FGF信号通路,同时发现LRP6等功能候选基因。该研究确定了与尾椎数相关的受选择区域,推测不同尾椎数蒙古绵羊群体的形成可能由非基因编码区域的一个或者多个突变造成。
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