【摘 要】
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目的 明确2008年山东省临沂市郯城县无菌性脑膜炎暴发的病原,对分离到的柯萨奇B3病毒的基因特征、遗传变异规律及进化来源进行分析.方法 采集暴发病例的粪便、脑脊液标本,应用RD、Hep-2细胞进行病毒分离;阳性分离物分别采用中和试验、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和核苷酸序列测定方法进行定型,最后与GenBank中检索到的其他CVB3毒株进行同源性分析,并构建VP1完整编码区亲缘进化树研究
【机 构】
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250012,山东,山东大学公共卫生学院流行病与卫生统计学研究所,山东省疾病预防控制中心,250012,山东,山东大学公共卫生学院流行病与卫生统计学研究所,山东省疾病预防控制中心,山东省疾病预防控制中
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目的 明确2008年山东省临沂市郯城县无菌性脑膜炎暴发的病原,对分离到的柯萨奇B3病毒的基因特征、遗传变异规律及进化来源进行分析.方法 采集暴发病例的粪便、脑脊液标本,应用RD、Hep-2细胞进行病毒分离;阳性分离物分别采用中和试验、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和核苷酸序列测定方法进行定型,最后与GenBank中检索到的其他CVB3毒株进行同源性分析,并构建VP1完整编码区亲缘进化树研究其遗传进化规律.结果 共采集22份粪便和120份脑脊液标本,分离到病毒35株,经鉴定34株为CVB3,1株为ECH030.34株CVB3分离株VP1区部分序列(381 bp)核苷酸同源性为90.5%～100%,氨基酸同源性为98.4%～100%;与Nancy原型株的核苷酸同源性为79.5%～81.6%,氨基酸同源性为98.4%～99.2%.012/2008TC/SD/CHN和177/2008TC/SD/CHN与安徽2008年分离的Fuyang19株同源性最高,核苷酸同源性分别为98.2%和91.0%,氨基酸同源性分别为99.2%和98.9%;进化树分析显示,中国大陆分离株独处一支,且呈单源性发生关系.结论 此次脑膜炎暴发的病原是CVB3.它与其他的中国分离株同源性高,与国外分离到的CVB3具有不同的基因特征。
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