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目的：建立蛋白质多重序列的质量评估法。方法：假定在多重序列比对中的一条序列是未知的，以其他序列作为模板，通过将模板蛋白质的三维结构作为未知蛋白质的预测模型，进而比较预测与实际结构的相似性，将它们的平均值作为多重序列比对的质量。结果：通过SCOP数据库的检验，所得的质量标准与专家分类的标准基本一致。结论：本方法是一种有效的蛋白质多重序列比对的质量评估法。