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目的建立甘肃产当归功效的分子系统学基础，为甘肃产当归“道地性”提供分子依据。方法采用PCR技术获得ITS基因，进行测序，经软件进行统计分析，计算各样本间的遗传距离。结果甘肃岷、漳两县当归ITS序列差异极小，在0．0000-0．0083之间，岷县5个样品与漳县DG9号样品在586位都为C，589位都为T，而漳县其他3个样品在这2个位点分别为T和G。结论ITS序列特征可以作为当归种间鉴别的有效分子标记，当归ITS序列第586位和589位2个位点碱基可能成为“岷当归”的碱基鉴别位点。