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采用rep-PER技术对福建省189个稻瘟病菌菌株进行DNA指纹图谱分析．结果表明：在58％相似水平上可以将供试菌株分为15个遗传谱系，表明该菌具有丰富的多态性．其中谱系FJL04出现频率为35．98％，为优势谱系．利用全国统一生理小种鉴别体系和LTH-NILs鉴别体系从供试的189个稻瘟病菌株中分别鉴别出15和21个致病型（生理小种），优势型分别为ZB13和J76．2，出现频率分别为58．72％和28．57％．采用这2套鉴别体系鉴别的致病型与DNA指纹图谱之间无明显的对应关系．