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Pi35是具有广谱持久抗性的水稻抗稻瘟病基因，在水稻抗病育种中具有重要作用。通过将不同等位基因测序及序列比对鉴定到1个Pi35基因内特异SNP位点并开发了一套鉴定该SNP的分子标记引物研究结果表明，利用该引物对水稻DNA进行PCR扩增，可快速判断待测水稻Pi35的基因型。该方法简便快速、成本低廉，可广泛应用于分子标记辅助选择育种或者水稻种质资源Pi35基因型鉴定。