一株木质纤维素降解菌的筛选及其全基因组分析

来源 :微生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huijinbao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】筛选和鉴定有木质纤维素降解能力的1株细菌,测定其相关酶活力并进行全基因组分析,为构建木质纤维素降解工程菌提供依据。【方法】采用3种木质素类似物(天青-B;酚红;愈创木酚)的脱色/染色法,从腐木和被枝叶覆盖的土壤中分离和筛选出1株具有较强木质纤维素降解能力的细菌。通过16S r RNA基因和全基因组序列分析对该菌进行种属鉴定。使用紫外分光光度法测定其锰过氧化物酶(Mn P)、漆酶(Lac)、羧甲基纤维素酶(CMCase)以及滤纸酶(FPA)活力,了解该菌相关酶活力大小在一定时间内的变化趋势。使用Illumina Miseq和454 GS Junior测序平台获取该菌的全基因组序列,将其全基因组序列经过注释的基因蛋白质序列提交COG和KEGG数据库进行BLASTp比对分析,确定该菌潜在的重要酶类和代谢途径,并对部分注释基因进行定量RT-PCR验证。【结果】筛选得到1株优势菌株S12,该菌经鉴定后命名为解鸟氨酸拉乌尔菌(Raoultella ornithinolytica)。在液体CMC-Na培养基中发酵28 h,菌体生长达到稳定期,纤维素降解相关酶活力也在此时达到峰值。生物信息学分析结果表明,菌株S12具有木质素降解通路中重要酶类的编码基因,如过氧化物酶、Fe-Mn型超氧化物歧化酶、邻苯二酚1,2-双加氧酶和原儿茶酸-3,4-双加氧酶等,这些基因在以碱性木质素为碳源的培养条件下表达量不同程度地高于以葡萄糖为碳源的培养条件。另外,菌株S12具备完整的纤维素降解和乙醇生成通路。【结论】本研究首次揭示了Raoultella ornithinolytica S12具备有效的木质纤维素降解性能,这对于推动木质纤维素应用产业的发展具有重要意义。
其他文献
制备了以混合金属氧化物为载体的负载型杂多酸盐HPA/三氧化钨-三氧化钼催化剂,对其进行了表征,并用于催化合成油酸正丁酯,试验其催化活性.结果表明,HPA/三氧化钨-三氧化钼是
食品过敏已成为重要的食品安全问题之一,检测食物过敏源对保护过敏患者具有重要意义,液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)具有快速、准确和高灵敏度等特点,广泛应用于食物过敏源蛋
目的探讨醛化鸡红细胞与植物血凝素(PHA)直接凝集模拟间接血球凝集试验的可行性.方法采用醛化试剂戊二醛对新鲜鸡红细胞进行醛化,制成模拟'致敏血球',与倍比稀释的PH
【正】抗战爆发前,国民政府对于国家高等教育并无明确方针,只是沿用1929年公布的《大学组织法》、《大学规程》作为相应的指导性政策。到了三十年代中期,中国高等教育的基本
中国地貌全图研制陈志明,刘振东,于秀波(中科院南京地理与湖泊研究所)1:400万中国与邻区地貌图由地理、地质和海洋等专业的九个单位共同合作,在开展全国性卫星影象和地学图件资料对比研
扫描电子显微镜是对纤维进行形貌观察、研究的重要手段.本文利用扫描电镜对丝织品老化原因及程度进行了分析研究.所用样品为人工老化的白色丝织品和分别来自湖北、内蒙古、青
论述了脾虚血瘀形成的机理以及脾虚血瘀证在微循环和血液流变学中的体现,进而阐述了活血化瘀药在脾虚证中的运用.
为了研究氮添加对森林土壤有机碳氮组分稳定性的影响,选取我国亚热带典型常绿阔叶林(浙江桂天然林和罗浮栲天然林)和针叶林(杉木人工林),开展为期5年的野外模拟氮沉降试验,分别设
在氮气氛中采用热重分析的方法对聚萘二甲酸乙二酯(PEN)的热降解动力学进行了研究。采用Friedman和Chang两种单一加热速率方法对活化能Ea反应级数n和频率因子Z等降解反应动力学
目前,随着我国医疗制度的不断改革,从而促进医疗单位实现了更加快速的发展。在医院各项管理工作中,财务管理属于其中非常重要的一项组成部分,其管理质量在一定程度上将直接影