论文部分内容阅读
目的分析感染性疾病的微生物宏基因组测序结果,比较两个数据库注释结果的一致性。方法收集感染性疾病患者的不同类型临床标本,进行宏基因组二代测序,分别采用NCBI NR数据库和MetaPhlAn2数据库注释测序结果,并进行一致性检验。结果2019年6月—2020年10月,在上海市4家医院内收集疑似感染性疾病患者174份标本的宏基因组测序数据进行分析。NCBI数据库阳性检出率为67.2%,MetaPhlAn2数据库阳性检出率为93.1%。不同类型标本的微生物检出率存在差异,外周血和脑脊液的检出率相对较低,其他标本