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基因表达式编程(Cene Expression Programming,GEP)在处理复杂长基因时的空间、时间效率较低,为解决这一问题,提出并实现了具有线性复杂度的染色体适应度评价算法。分析了传统CEP算法中借助ET(Expression Tree)树进行染色体适应度评价的局限性;提出并实现了具有线性复杂度的染色体适应度评价算法LDeeode算法;针对染色体长度、种群大小、测试数据集大小、进化代数等不同参数,对提出的染色体适应度评价算法进行了评价和分析。试验表明,提出的评价算法运行速度较传统基于ET树