猪ALCAM基因密码子偏好性分析、蛋白结构功能预测以及组织表达谱检测

来源 :中国畜牧杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：kanjiusheng

【摘要】

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为探讨猪活化白细胞黏附分子(Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule,ALCAM)基因的结构与功能,本研究运用EMBOSS和Codon W软件分析猪ALCAM基因密码子使用偏好性,运用生

【作者】

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许写陈瑜哲杨建生吴正常包文斌吴圣龙

【机构】

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扬州大学动物科学与技术学院,昆山市畜牧兽医站

【出处】

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中国畜牧杂志

【发表日期】

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2020年11期

【关键词】

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猪 ALCAM基因密码子偏好性生物信息学组织表达谱 PigALCAM geneCodon biasBioinformaticsTissue express

【基金项目】

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江苏省自然科学基金(BK20180899),扬州市自然科学基金(YZ2018102)

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为探讨猪活化白细胞黏附分子(Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule,ALCAM)基因的结构与功能,本研究运用EMBOSS和Codon W软件分析猪ALCAM基因密码子使用偏好性,运用生物信息学相关软件分析ALCAM蛋白的理化性质、结构功能并预测与其存在互作关系的蛋白,运用实时荧光定量的方法检测ALCAM基因在梅山猪不同组织中的表达水平。结果表明:ALCAM基因偏好使用以A/U结尾的密码子,存在28个偏好性较强的密码子(RSCU值>1),其中CGG、AGA

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