【摘 要】
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目的采用单细胞测序分析溃疡性结肠炎（ulcerative colitis, UC）患者肠道组织中巨噬细胞差异基因及其功能。方法挖掘数据集GSE150115,分析5例UC患者肠黏膜组织10×Genomics单细胞转录组测序数据,采用Seurat软件进行细胞亚群分类、巨噬细胞识别、细胞间差异基因筛选、GO和KEGG生物信息学分析。结果从10个细胞亚群中识别出巨噬细胞,筛选出细胞间差异基因,如CR1、B
【机 构】
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南京医科大学附属淮安第一医院消化内科
【基金项目】
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江苏省卫生健康委科研课题（H2018082）； 淮安市自然科学研究计划课题（HAB201926）； 淮安市第一人民医院转化医学创新团队科研项目（YZHT201905）；
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目的采用单细胞测序分析溃疡性结肠炎（ulcerative colitis, UC）患者肠道组织中巨噬细胞差异基因及其功能。方法挖掘数据集GSE150115,分析5例UC患者肠黏膜组织10×Genomics单细胞转录组测序数据,采用Seurat软件进行细胞亚群分类、巨噬细胞识别、细胞间差异基因筛选、GO和KEGG生物信息学分析。结果从10个细胞亚群中识别出巨噬细胞,筛选出细胞间差异基因,如CR1、BCL11A等。GO及KEGG分析发现,巨噬细胞的核糖体信号通路可能参与UC疾病过程。结论肠道巨噬细胞可能通过核糖体信号通路影响UC。
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