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干细胞具有自我更新和多种分化潜能的特性。干细胞向分化细胞的转变涉及到基因表达模式的改变，与自我更新有关的基因关闭．与细胞特化有关的基因激活。表观遗传调控机制，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和微RNA（microRNA）介导的基因调控，在多个层面上控制发育过程中基因表达。近年研究表明，动态的表观遗传调控机制在干细胞自我更新和分化中起关键作用。