蛋白质序列复杂性简化与非比对序列分析

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【摘要】

：

非比对序列分析是最新发展的一种序列分析方法，具有计算效率高并适用于分析低相似性的序列，已成功用于DNA的序列分析中．但是由于蛋白质序列的复杂性，非比对序列分析对于蛋白质序

【作者】

：

李菁李逢博王炜

【机构】

：

南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室

【出处】

：

生物化学与生物物理进展

【发表日期】

：

2006年12期

【关键词】

：

非比对序列分析氨基酸残基归类序列复杂性简化

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(90403120,10474041,10021001)~~

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非比对序列分析是最新发展的一种序列分析方法，具有计算效率高并适用于分析低相似性的序列，已成功用于DNA的序列分析中．但是由于蛋白质序列的复杂性，非比对序列分析对于蛋白质序列分析的准确度却不高．用将20种天然氨基酸残基归类的方法，简化了蛋白质序列的复杂性，并运用到对蛋白质的非比对序列分析中，有效地提高了序列分析的准确性.

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