泉州地区2014—2017年活禽相关外环境禽流感病毒监测及遗传进化特征

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cx313
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目的

分析泉州地区2014—2017年活禽相关外环境中H5、H7、H9亚型禽流感病毒的分布情况和分子生物学特点,为本地区人感染禽流感的防控和预警提供参考依据。

方法

采集泉州地区活禽监测场所标本,采用实时荧光定量PCR方法检测甲型流感病毒以及H5、H7、H9亚型禽流感病毒,然后对检测结果进行统计学分析;并对4株代表性H7N9禽流感病毒毒株的HA和NA基因进行核苷酸序列测定和同源性分析,用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析。

结果

外环境标本甲型流感病毒核酸阳性率为29.04%(377/1 289),其中H5、H7、H9亚型的阳性率分别为3.80%、13.34%、12.02%。各监测年份中,H7N9阳性率均高于其它亚型,其中2017年最高(21.88%)。不同类型标本中,案板的H7N9阳性率最高(65.4%)、污水次之(59.3%)、禽类饮水最低(29.6%)。采集场所中,最高的是农贸市场(61.7%)和活禽交易市场(52.8%)。对4株H7N9病毒的HA和NA基因序列分析显示,外环境和人源病毒分别属于珠江三角洲和长江三角洲谱系。HA蛋白的裂解位点均为PKGR/G,没有发生高致病性突变;NA蛋白292位氨基酸都为R,没有出现奥司他韦耐药突变;PB2蛋白中,627位氨基酸从E突变为了K,526位和701位氨基酸没有出现突变。

结论

泉州地区活禽相关外环境存在H7N9禽流感病毒污染,特别是农贸市场和活禽交易市场是人感染H7N9亚型的高风险场所,需要加强监测。

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