利用生物信息学技术挑选TLR2基因标签单核苷酸多态性位点

来源 :基础医学与临床 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yixiangren1976

【摘要】

：

目的利用生物信息学技术挑选中国人群中的TLR2基因标签单核苷酸多态性（SNP）位点。方法利用NCBI数据库,确定TLR2基因研究范围,并利用Hapmap数据库下载中国人群的TLR2基因的SNPs

【作者】

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陈客宏曾灵顾玮黄苏娜刘庆蒋建新

【机构】

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第三军医大学大坪医院野战外科研究所创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室第四研究室

【出处】

：

基础医学与临床

【发表日期】

：

2010年3期

【关键词】

：

TLR2 单倍域标签SNP 单倍型 TLR2 haplotype block tag SNP haplotype

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目的利用生物信息学技术挑选中国人群中的TLR2基因标签单核苷酸多态性（SNP）位点。方法利用NCBI数据库,确定TLR2基因研究范围,并利用Hapmap数据库下载中国人群的TLR2基因的SNPs数据;使用Haploview4.0软件对TLR2基因进行了连锁不平衡分析;通过对D值95%可信区间上下限的分析,在整个TLR2基因范围内构建单倍域（haplotype block）;然后根据单倍域内SNPs之间的r2值和LOD值,挑选标签SNP;最后根据单倍域内的单倍型所占比例,挑选出标签SNP代表的单倍型。结果在

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